Der Fachschaftsrat Informatik unterhält verschiedene Arbeitsgruppen, um bestimmte Aufgaben zu erledigen oder Events zu organisieren. Dabei gibt es Arbeitsgruppen, welche speziell für eine Veranstaltung oder ein Anliegen gebildet werden und dauerhaft bestehende Arbeitsgruppen, die Aufgaben des Fachschaftsrates bearbeiten.
Die Aufgabe der ESE AG ist die Organisation der Erstsemestereinführung. Dazu gehören die Abstimmung mit der Faktultät und dem Bereich Informatik, sowie die Organisation der Veranstaltungen des Fachschaftsrates. Außerdem erstellt sie den Ersti-Führer (THE MANUAL).
Das IT-Team verwaltet und betreut alle IT-Ressourcen, welche im Verantwortungsbereich des Fachschaftsrates liegen. Dazu zählen virtuelle Maschinen, welche für Projekte wie die Erstsemestereinführung benötigt werden, und selbst betriebe Online-Dienste wie das kollaborative Online-Tool HedgeDoc.
Die Arbeitsgruppe Mentoring ist in jeder Amtszeit des Fachschaftsrates Informatik zu bilden und organisiert das Mentoringangebot des Fachschaftsrates. Dazu zählt das Finden von Mentoren vor Beginn des neuen Wintersemesters, die Verteilung der Mentees auf die Mentoren und weiteres Organisatorisches im Zusammenhang mit dem Mentorenprogramm.